49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06990 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69783  predicted protein  79.27 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00262  60S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_1G03390)  76.97 
 
 		 165 aa  257  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113826 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  68.07 
 
 		 166 aa  226  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  64.63 
 
 		 164 aa  220  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  33.57 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  34.27 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  35.95 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  30.72 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  31.13 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  31.94 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  29.56 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  28.76 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  28.76 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  31.37 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  29.41 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  28.48 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  29.03 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  28.28 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  28.57 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  27.78 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  28.1 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  26.85 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  25.49 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  25 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  28.17 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  28.15 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  28.67 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  24.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  27.97 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  30.07 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  29.93 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  28.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  27.89 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  23.23 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  27.27 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  26.43 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  22.73 
 
 		 167 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  28.07 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  25.18 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  26.43 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  23.74 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  28.26 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  25 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  26.95 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  27.94 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  29.17 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>