More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0269 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
154 aa  306  8e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
141 aa  193  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 
141 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  191  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 
141 aa  189  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 
141 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
142 aa  187  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 
143 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  63.12 
 
 
141 aa  183  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  65.47 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
141 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
141 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  61.87 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  180  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  178  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  60 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
141 aa  176  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  60.14 
 
 
143 aa  176  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
142 aa  176  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  176  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  59.29 
 
 
141 aa  174  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  59.85 
 
 
143 aa  174  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
164 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 
145 aa  174  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  173  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  61.87 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
141 aa  171  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  60.14 
 
 
143 aa  170  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  58.16 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  58.82 
 
 
143 aa  170  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  59.71 
 
 
144 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 
143 aa  169  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
146 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 
142 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
140 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  168  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 
141 aa  167  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  56.83 
 
 
140 aa  168  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  57.25 
 
 
142 aa  167  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 
141 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 
141 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  57.14 
 
 
141 aa  167  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
140 aa  167  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  167  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
140 aa  167  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  58.39 
 
 
143 aa  167  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  60.14 
 
 
143 aa  167  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  56.83 
 
 
143 aa  166  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  166  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  59.29 
 
 
140 aa  166  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  61.59 
 
 
142 aa  166  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
145 aa  166  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
147 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>