34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69783 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_69783  predicted protein  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  79.27 
 
 
165 aa  266  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00262  60S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_1G03390)  69.94 
 
 
165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113826 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  64.24 
 
 
166 aa  220  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  63.19 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  37.67 
 
 
159 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  36.99 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  38.36 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  33.77 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  33.77 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  36.3 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  35.06 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  34.01 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  34.25 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  31.97 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  33.56 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  32 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  32.69 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  31.29 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  28.97 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  28.03 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  31.97 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  27.59 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  26.03 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  27.4 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  26.03 
 
 
166 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  24.34 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  27.27 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  23.97 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  35 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  23.97 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  23.97 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  24.46 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  26.24 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>