36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28979 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  64.63 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  66.67 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355279 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69783  predicted protein  63.19 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00262  60S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_1G03390)  62.2 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  31.82 
 
 		 159 aa  84.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  32.69 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  32.69 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  33.12 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  32.67 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  33.1 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  33.1 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  33.33 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  33.57 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  31.61 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  31.51 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  32.41 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  33.1 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  33.11 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  29.86 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  31.68 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  29.56 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  29.45 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  27.59 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  26.03 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  24.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  23.97 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  22.73 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  23.29 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  23.29 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  21.25 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  31.67 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  25.69 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  32.26 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  27.08 
 
 		 142 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  26.76 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>