More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1009 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  74.84 
 
 
159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  74.84 
 
 
159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  73.58 
 
 
159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  74.21 
 
 
159 aa  249  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  62.34 
 
 
161 aa  196  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  61.84 
 
 
158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  62.58 
 
 
158 aa  187  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  58.33 
 
 
161 aa  183  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  59.6 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  56.13 
 
 
158 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  60 
 
 
158 aa  178  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  56.13 
 
 
157 aa  175  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  53.25 
 
 
159 aa  168  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  47.17 
 
 
159 aa  158  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  49.67 
 
 
162 aa  157  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  48.37 
 
 
162 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  47.1 
 
 
162 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  45.81 
 
 
158 aa  147  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  46.36 
 
 
157 aa  147  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  54.05 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  40.24 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  36.88 
 
 
168 aa  117  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  37.86 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 
141 aa  97.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  36.76 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  40.44 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  41.3 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  40.6 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  36.73 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  40.71 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  38.52 
 
 
141 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  36.73 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
144 aa  94.4  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  34.38 
 
 
165 aa  94.4  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  36.09 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  37.59 
 
 
140 aa  94  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  41.13 
 
 
141 aa  94  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  40 
 
 
141 aa  94  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  34.16 
 
 
167 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  37.04 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  37.93 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  37.59 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  39.26 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  38.3 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.97 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  38.64 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.81 
 
 
142 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
144 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  37.88 
 
 
141 aa  91.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
141 aa  91.7  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  38.62 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  39.29 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  39.29 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0593  50S ribosomal protein L11  41.86 
 
 
141 aa  90.9  7e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  40 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 
141 aa  90.5  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  37.14 
 
 
141 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  38.35 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30315  Putative mitochondrial ribosomal protein L11  37.32 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  39.29 
 
 
141 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  37.5 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  34.62 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  36.84 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  38.76 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  40.43 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  36.3 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  38.81 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  38.3 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  38.76 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  38.3 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 
142 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  37.14 
 
 
145 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  38.62 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  37.31 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>