More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2252 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  78.21 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  75.8 
 
 		 158 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  73.89 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  71.15 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  62.58 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  61.39 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  61.39 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  62.03 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  60.76 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  57.69 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  54.49 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  60.42 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  50.63 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  48.1 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  50 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  51.92 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  49.36 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  48.08 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  50 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  51.97 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  43.95 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  42 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  43.94 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  42.42 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  40.88 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  39.71 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  35 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.52 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  36.5 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 141 aa  97.1  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  97.1  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  38.35 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  39.39 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  37.68 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  36.96 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  35.29 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  35.9 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>