More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1634 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 168 aa  325  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  72.89 
 
 		 170 aa  249  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  44.03 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  38.71 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  38.71 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  43.84 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  37.42 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  41.29 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  37.82 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  41.33 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  40.79 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  38.99 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  40.13 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  36.88 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  42 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  39.47 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  37.11 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  39.38 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  36.88 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  43.33 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  37.5 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  37.82 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  37.82 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  36.75 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.44 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  35.12 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  32.14 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  39.44 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  37.41 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  37.98 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  35.54 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  94  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 144 aa  94  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  40.14 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  39.44 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 142 aa  92.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 142 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  35.29 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  37.76 
 
 		 142 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  37.76 
 
 		 142 aa  90.9  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  35.92 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  37.86 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  39.01 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  37.14 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  38.73 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  35.77 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  37.06 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  38.03 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  35.92 
 
 		 141 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  35.21 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  37.86 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  38.57 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  37.76 
 
 		 142 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  35.46 
 
 		 141 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  35.21 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  36.62 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  36.62 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  34.29 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  35.92 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  34.29 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  35 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  36.62 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  36.43 
 
 		 141 aa  86.7  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  36.17 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  33.58 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 143 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  33.8 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04534  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 142 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  34.51 
 
 		 143 aa  84.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>