251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1656 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 
167 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  80.84 
 
 
167 aa  292  2e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  78.79 
 
 
165 aa  276  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  74.85 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  40.24 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  34.13 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  32.14 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  31.45 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  31.45 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  31.87 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  32.26 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  30.82 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  30.77 
 
 
161 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  33.33 
 
 
161 aa  87  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  34.48 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  30 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  30.72 
 
 
158 aa  84  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  30.52 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  33.12 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  34.84 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  29.22 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  32.03 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  27.92 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  30.32 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  27.92 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  29.22 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  27.04 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  26.17 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  30 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  30.71 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  27.61 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  28.78 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  30 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  28.77 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  28.57 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  26.21 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  27.01 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  27.61 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  27.01 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  27.14 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  25.71 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  27.66 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  28.87 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  28.89 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  26.28 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  26.87 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  30.22 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  27.14 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  29.63 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  29.86 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  26.24 
 
 
142 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  28.28 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  29.29 
 
 
140 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  29.29 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  27.61 
 
 
143 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  26.12 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  26.12 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  26.43 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  26.12 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  27.34 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  27.94 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  30.56 
 
 
141 aa  50.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  26.12 
 
 
142 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  28.77 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  27.86 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  28.87 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  26.12 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  26.06 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0387  ribosomal protein L11  32.14 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  26.52 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  28.37 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  30.67 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  27.94 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  27.94 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  30.67 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  28.67 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  24.31 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  24.65 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  27.34 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  28.67 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  26.43 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  26.76 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  27.66 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  27.21 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>