More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0615 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 161 aa  318  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  75.16 
 
 		 161 aa  256  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  58.6 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  63.51 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  58.97 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  56.96 
 
 		 158 aa  187  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  57.05 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  58.33 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  57.79 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  57.79 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  57.14 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  54.49 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  55.84 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  54.49 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  49.68 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  49.36 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  51.66 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  46.15 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  51.95 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  43.75 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  39.38 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  41.18 
 
 		 140 aa  111  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  40.15 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  42.19 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  41.01 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  37.14 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  40.88 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  39.86 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  38.85 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  37.68 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  40.15 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  39.42 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  39.13 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  39.06 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  39.57 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  40.3 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.84 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  40.62 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  39.42 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.96 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  39.13 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  40.44 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  40.94 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  39.06 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  39.86 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  39.86 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  39.42 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  39.84 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  42.52 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>