More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1514 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  100 
 
 
162 aa  315  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  91.67 
 
 
157 aa  283  8e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  83.95 
 
 
162 aa  274  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  81.65 
 
 
158 aa  254  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  77.16 
 
 
162 aa  252  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  50.96 
 
 
158 aa  169  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  51.28 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  52.23 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  49.36 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  50 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  49.36 
 
 
161 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  50 
 
 
161 aa  158  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  47.68 
 
 
159 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  47.68 
 
 
159 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  47.02 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  47.1 
 
 
160 aa  148  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  45.7 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  44.23 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  48.68 
 
 
158 aa  144  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  40.4 
 
 
159 aa  124  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  39.61 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  45.19 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  43.7 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  43.28 
 
 
141 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  42.86 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  43.8 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  44.44 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  42.75 
 
 
142 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  46.56 
 
 
142 aa  110  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  37.82 
 
 
168 aa  110  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  42.65 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  44.03 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  40.58 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  41.61 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  41.55 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  43.7 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  39.42 
 
 
141 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  41.67 
 
 
145 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  43.28 
 
 
142 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  37.23 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 
140 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  41.61 
 
 
144 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 
142 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
140 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  41.18 
 
 
143 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 
140 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
140 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  42.75 
 
 
140 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  40.91 
 
 
141 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  38.64 
 
 
140 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  42.96 
 
 
143 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 
141 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
145 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  38.81 
 
 
146 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
141 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
141 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  42.22 
 
 
143 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  42.22 
 
 
143 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  40.15 
 
 
140 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 
146 aa  104  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
140 aa  103  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  40.46 
 
 
141 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 
143 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 
141 aa  103  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 
141 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 
141 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 
141 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  41.73 
 
 
144 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  41.98 
 
 
144 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 
141 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>