More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0863 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  100 
 
 
158 aa  307  2.9999999999999997e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  63.51 
 
 
161 aa  187  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  62.84 
 
 
161 aa  183  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  59.6 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  56.95 
 
 
159 aa  179  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  58.9 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  58.9 
 
 
159 aa  177  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  58.9 
 
 
159 aa  177  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  60 
 
 
158 aa  176  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  59.21 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  60.42 
 
 
158 aa  170  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  55.92 
 
 
157 aa  168  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  55.92 
 
 
158 aa  168  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  56 
 
 
159 aa  164  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  52.11 
 
 
159 aa  154  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  50 
 
 
157 aa  150  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  50 
 
 
162 aa  147  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  47.37 
 
 
162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  55.48 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  49.66 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  48.68 
 
 
162 aa  144  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  47.22 
 
 
170 aa  135  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  43.84 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  40.15 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  40.65 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  42.75 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  40.43 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  42.22 
 
 
144 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  40.58 
 
 
141 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  43.7 
 
 
143 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  41.79 
 
 
143 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  44.03 
 
 
141 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 
141 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 
141 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
145 aa  104  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  43.7 
 
 
143 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  41.35 
 
 
141 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  42.22 
 
 
144 aa  104  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  40.6 
 
 
140 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 
141 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 
141 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  42.11 
 
 
143 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  41.3 
 
 
143 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 
141 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  40.58 
 
 
141 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  42.65 
 
 
148 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
164 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  40.3 
 
 
148 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  41.04 
 
 
143 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  41.61 
 
 
142 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  42.11 
 
 
141 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  42.65 
 
 
142 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  42.11 
 
 
142 aa  101  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  41.48 
 
 
141 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  42.11 
 
 
143 aa  101  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 
140 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  39.26 
 
 
144 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  40.74 
 
 
144 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  42.11 
 
 
141 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
143 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  42.11 
 
 
141 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  40.74 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
143 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
143 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  43.18 
 
 
141 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  41.67 
 
 
144 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  39.85 
 
 
140 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  44.78 
 
 
143 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  40.44 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.85 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  41.79 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  43.38 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
141 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  38.81 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  39.55 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  42.65 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  39.86 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  40.6 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  39.71 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 
142 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>