More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0145 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  96.86 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  96.86 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  86.16 
 
 		 159 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  73.58 
 
 		 160 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  60.76 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  59.35 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  58.86 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  57.14 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  57.59 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  58.23 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  58.9 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  52.53 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  54.19 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  55.7 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  48.34 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  49.01 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  56.08 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  47.02 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  46.41 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  46.75 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  40.51 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  37.42 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  40.88 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  43.94 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  41.48 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  41.43 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  39.26 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  41.43 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  40.43 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  39.86 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  38.69 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  38.89 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.89 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  39.26 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  33.75 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  39.29 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  37.76 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  39.71 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 140 aa  94.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 140 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  32.72 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  39.16 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  36.05 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  37.41 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0593  50S ribosomal protein L11  41.09 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.06 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  38.3 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  37.59 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  37.59 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  35.97 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  36.11 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  38.57 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  39.01 
 
 		 140 aa  91.3  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  36.84 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  37.06 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  34.69 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  36.88 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  36.88 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  30.82 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  38.3 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  39.26 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  36.96 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  33.55 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  37.32 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>