More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0224 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  56.08 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  56.08 
 
 		 159 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  56.08 
 
 		 159 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  56.08 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  54.05 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  55.48 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  46.3 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  53.33 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  51.95 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  54.42 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  52.63 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  50.66 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  52.9 
 
 		 157 aa  148  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  51.35 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  51.97 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  44.03 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  44.74 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  44.08 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  44.08 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  44.44 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  42.75 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  41.45 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  46.83 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  46.03 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  43.61 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  43.38 
 
 		 141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  44.19 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  44.19 
 
 		 141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  45.67 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  42.86 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  45.67 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  42.96 
 
 		 141 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  43.75 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  44.96 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  44.78 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  46.4 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  46.4 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  41.54 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  42.86 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  41.91 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  45.31 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  42.97 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  41.38 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  42.31 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  45.74 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  44.7 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  42.06 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  44.62 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  42.64 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  42.31 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  43.08 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  43.75 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  41.86 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  40.6 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  42.64 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  43.75 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  42.19 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  42.97 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  41.35 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  40.31 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  42.97 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  44.76 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  45.04 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 		 141 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 141 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  43.51 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  42.14 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  40.31 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  45.04 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  44 
 
 		 141 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  42.97 
 
 		 142 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  43.41 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  44.06 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  43.51 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  44.44 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  42.75 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  40.31 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  42.64 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  45.31 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  40.31 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  41.09 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  44.27 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  43.75 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  43.51 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>