More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0744 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  87.42 
 
 
159 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  87.42 
 
 
159 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  86.16 
 
 
159 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  74.21 
 
 
160 aa  249  9.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  62.03 
 
 
158 aa  186  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  59.49 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 
157 aa  181  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  58.71 
 
 
161 aa  179  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  56.95 
 
 
158 aa  179  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  53.8 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  57.59 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  56.33 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  55.84 
 
 
161 aa  175  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  53.55 
 
 
159 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  47.02 
 
 
162 aa  154  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  56.08 
 
 
168 aa  150  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  45.7 
 
 
157 aa  148  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  45.7 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  44.81 
 
 
158 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  44.67 
 
 
162 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  39.24 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  37.82 
 
 
168 aa  123  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  39.86 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 
141 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
141 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 
141 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  41.43 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  41.43 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 
148 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.72 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  39.86 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  37.93 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  39.86 
 
 
143 aa  98.2  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  40.91 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
141 aa  97.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  37.78 
 
 
144 aa  97.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  40 
 
 
144 aa  97.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  40.43 
 
 
141 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  38.89 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  40.43 
 
 
141 aa  97.1  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  36.13 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0593  50S ribosomal protein L11  44.19 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  40 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  36.73 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  38.85 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  36.73 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  39.13 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  38.13 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  39.71 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  33.75 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  39.26 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  37.31 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  39.13 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  39.01 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  37.93 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  38.06 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  32.5 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  40 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  40 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  37.68 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  41.43 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  39.01 
 
 
141 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
140 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  39.01 
 
 
141 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  40.71 
 
 
141 aa  94  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  35.66 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  38.35 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  37.76 
 
 
143 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  38.64 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  38.69 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2200  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0220  50S ribosomal protein L11  39.13 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.06 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2111  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000939777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  38.46 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  34.01 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  37.04 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  39.13 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>