145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1832 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 166 aa  327  6e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  76.05 
 
 		 167 aa  261  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  78.18 
 
 		 165 aa  261  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  74.85 
 
 		 167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  42.07 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  35.54 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  35.12 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  36.13 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  34.19 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  34.19 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  33.55 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  34.62 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  35.06 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  34.19 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  35.48 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  37.18 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  35.57 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  30.82 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  32.28 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  29.61 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  33.12 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  34.01 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  32.68 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  29.3 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  30.07 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  31.37 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  30.52 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  27.15 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  27.01 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  28.87 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  29.29 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  29.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  29.63 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  30.43 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  31.69 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  29.29 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  29.29 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  29.29 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  29.79 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  29.08 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  29.31 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  31.47 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  28.15 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  28.37 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  30.43 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  27.21 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  28.37 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00262  60S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_1G03390)  27.1 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  28.37 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69783  predicted protein  26.03 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  30.28 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  28.36 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  22.73 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0395  50S ribosomal protein L11  29.57 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00763778  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  26.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  26.52 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  28.47 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  29.93 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  26.24 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.85 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  26.87 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1419  50S ribosomal protein L11P  31.2 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000108032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  27.07 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  28.68 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  30 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  28.68 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1333  50S ribosomal protein L11  26.52 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0880682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  27.54 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  27.41 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  27.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  27.94 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0387  ribosomal protein L11  31.34 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  30.07 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  28.06 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  27.46 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  27.94 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0165  50S ribosomal protein L11  25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>