37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34409 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00262  60S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_1G03390)  69.51 
 
 
165 aa  227  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113826 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  68.07 
 
 
165 aa  226  9e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69783  predicted protein  64.24 
 
 
165 aa  220  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  66.67 
 
 
164 aa  217  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  35.8 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  40.54 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  32.1 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  34.57 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  34.57 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  34.36 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  34.62 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  34.69 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  31.41 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  34.01 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  33.12 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  32.41 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  34.67 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  30.82 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  31.76 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  31.94 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  30.56 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  30.2 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  26.32 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  26.8 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  27.21 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  27.21 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  25 
 
 
162 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  26.85 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  24.66 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  26.81 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  24.34 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  28.06 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  27.78 
 
 
140 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  25.37 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  29.71 
 
 
141 aa  40.8  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  27.78 
 
 
140 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>