More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf144 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf144  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0065  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
142 aa  175  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl609  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
142 aa  167  5e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.220291  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0633  50S ribosomal protein L11  53.79 
 
 
150 aa  154  3e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00304315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
146 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  50.34 
 
 
147 aa  141  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
145 aa  140  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
145 aa  140  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
149 aa  140  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  48.97 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  48.97 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  48.28 
 
 
147 aa  136  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  51.75 
 
 
145 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
141 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  50.71 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  134  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  51.41 
 
 
143 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  50 
 
 
140 aa  133  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  47.59 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  49.32 
 
 
148 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  50.7 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  49.29 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  47.18 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  48.57 
 
 
141 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 
141 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  50.34 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  50.34 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  51.03 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
141 aa  130  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  130  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  50 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  46.48 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  48.25 
 
 
143 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  45.77 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  46.04 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  48.57 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  46.76 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  49.3 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  49.3 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  51.72 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  49.3 
 
 
143 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  47.89 
 
 
143 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 
144 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  46.48 
 
 
142 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  47.14 
 
 
140 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
143 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  45.77 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  50.34 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  45.71 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  47.86 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
140 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  47.52 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  48.95 
 
 
143 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  49.28 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  50 
 
 
163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  49.3 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  48.61 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  47.48 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  45 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>