More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl609 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl609  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.220291  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0065  50S ribosomal protein L11  82.86 
 
 
142 aa  239  1e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0633  50S ribosomal protein L11  61.76 
 
 
150 aa  169  1e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00304315  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf144  50S ribosomal protein L11  60 
 
 
147 aa  167  5e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  54.35 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  144  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  52.78 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  52.52 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  143  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  143  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  50 
 
 
141 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 
141 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  51.8 
 
 
143 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
140 aa  141  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 
141 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  50.72 
 
 
145 aa  140  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
141 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  52.59 
 
 
143 aa  140  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  54.81 
 
 
144 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  139  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  51.82 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  51.82 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  48.57 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  48.2 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  50.72 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
146 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  53.62 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  48.23 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  49.66 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  51.08 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  51.08 
 
 
143 aa  137  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  137  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  51.82 
 
 
142 aa  137  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  51.82 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
142 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
142 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
147 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  51.41 
 
 
145 aa  135  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  51.82 
 
 
144 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 
145 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  48.94 
 
 
147 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 
143 aa  135  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
143 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
142 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  51.09 
 
 
143 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 
142 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  47.48 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  46.58 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  46.81 
 
 
162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  51.82 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  49.29 
 
 
141 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  49.28 
 
 
143 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  46.76 
 
 
142 aa  133  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
141 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  48.91 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  47.45 
 
 
142 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  48.91 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  45.99 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  45 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  48.89 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  48.59 
 
 
145 aa  130  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
145 aa  130  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  50.7 
 
 
143 aa  130  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2129  ribosomal protein L11  49.58 
 
 
166 aa  130  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248839  normal  0.745271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  51.94 
 
 
144 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>