More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0065 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0065  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl609  50S ribosomal protein L11  82.86 
 
 		 142 aa  239  1e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.220291  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf144  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0633  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00304315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  49.32 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  52.86 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  47.59 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  46.81 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  49.29 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  50 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  47.59 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  47.86 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  51.77 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  48.55 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 		 141 aa  130  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  47.48 
 
 		 143 aa  129  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  51.08 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  51.43 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  46.38 
 
 		 145 aa  127  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2129  ribosomal protein L11  50.42 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248839  normal  0.745271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  45 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  46.43 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  44.29 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  43.57 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  43.57 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  50.72 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  44.44 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  43.88 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  47.14 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  43.57 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  48.25 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  45.26 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  43.17 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  42.14 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  44.6 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  45.39 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  45.32 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  45.77 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  42.45 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  42.45 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  44.68 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  43.88 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  43.66 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  43.17 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1419  50S ribosomal protein L11P  46.81 
 
 		 196 aa  121  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  47.45 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  50 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  49.3 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  46.04 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  46.72 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  41.43 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  46.67 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>