More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0521 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  80.58 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  186  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 141 aa  184  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  184  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  63.77 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  61.11 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  60.58 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  58.7 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  65.44 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  65.44 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  57.97 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  60.43 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  55.4 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  58.99 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  61.24 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>