More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7255 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
446 aa  859    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  60.28 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  54.5 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  52.76 
 
 
441 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  52.26 
 
 
441 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  47.34 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  45.03 
 
 
469 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
431 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
417 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.6 
 
 
425 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  43.16 
 
 
412 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  51.38 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  39.5 
 
 
425 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  47.5 
 
 
449 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  35.23 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  35.83 
 
 
461 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  32.99 
 
 
435 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
445 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
483 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  29.9 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  31.79 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  30.68 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
445 aa  94  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
425 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
441 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  32.6 
 
 
467 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  32.18 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
465 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  30.18 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
466 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  23.89 
 
 
491 aa  90.9  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  24.49 
 
 
466 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
468 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  30.14 
 
 
459 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  32.32 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  29.75 
 
 
440 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.44 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
469 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  29.92 
 
 
437 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  31.94 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  28.52 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  31.95 
 
 
434 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  26.69 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  23.79 
 
 
466 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  29.3 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  23.79 
 
 
466 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
440 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
413 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  23.64 
 
 
466 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  27.6 
 
 
446 aa  86.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  28.06 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.92 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  23.12 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  27.86 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  28.86 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  26.41 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  29.33 
 
 
449 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  23.83 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  22.81 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  27.99 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  34.35 
 
 
473 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  30.21 
 
 
529 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  32.34 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  28.04 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  28.57 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  29.71 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>