More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2455 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  98.19 
 
 		 441 aa  834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  849    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  50.84 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  51.17 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.73 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  49.17 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  41.49 
 
 		 469 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  43.26 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.12 
 
 		 425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  46.69 
 
 		 360 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  39.03 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  47.33 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 455 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  32.71 
 
 		 440 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  33.85 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  22.49 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.03 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.28 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.85 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  29.33 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.28 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.28 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  29.69 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  30.98 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.25 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  29.75 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  29.77 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  29.77 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  29.77 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  29.77 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  30.23 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.07 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  27.58 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  30.23 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  30.59 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  29.71 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.01 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  29.89 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  29.84 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  21.36 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  29.84 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.54 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  29.85 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  31.14 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  31.48 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.81 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  29.33 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  32.92 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  29.46 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  31 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  21.36 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  28.72 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  28.42 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  25.53 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  30.8 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  30.71 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>