More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1767 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  902    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  87.43 
 
 		 360 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  44.94 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  45.22 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.03 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  42.33 
 
 		 441 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  39.42 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  41.47 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.42 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  34.64 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  40.46 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  24.59 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  31.47 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  28.33 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  21.52 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  28.67 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  30.42 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  28.67 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.52 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  26.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  26.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  26.9 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  22.87 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  26.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.07 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.07 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  28.57 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.38 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  28.57 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  28.57 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.07 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.07 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.07 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  28.57 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  29.41 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.16 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.16 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  27.76 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.16 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  29.07 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  27.8 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  29.02 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  26.81 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  29.02 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  22.56 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.3 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  28.75 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  28.75 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  22.92 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.3 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  28.75 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.26 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  32.12 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  27.27 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.3 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  27.88 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  26.72 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  29.39 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  28.28 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  28.88 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  26.15 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  26.43 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.65 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  26.97 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1365  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.76 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>