More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5446 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 425 aa  803    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.81 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  49.88 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  42.55 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.6 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  43.69 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  46.93 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  39.58 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  42.09 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  41.81 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  41.07 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  37.1 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  44.53 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  32.34 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 509 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  29.71 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  24.61 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  32.75 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  32.12 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 574 aa  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  30.03 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  32.85 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  32.04 
 
 		 456 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  29.1 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  29.45 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  33.84 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  29.71 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  30.18 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  22.45 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.56 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.15 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  30.84 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  32.58 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  22.11 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.83 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  17.79 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  30.12 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  22.19 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  21.77 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  29.85 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  22.19 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.16 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  31.51 
 
 		 594 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  29.09 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  26.26 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  23.65 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.77 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  29.35 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  33.47 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  30.19 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  23.03 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  25.85 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  28.78 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.34 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5054  histidine kinase  24.1 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  28.16 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.37 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>