More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2388 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  62.81 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  61.21 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  63.39 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  64.37 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  44.34 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  51.72 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 428 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  42.22 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.89 
 
 		 425 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  40.04 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  35.48 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  38.48 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  32.74 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  34.87 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  28.7 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  30.57 
 
 		 571 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.26 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  34.07 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.63 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  32.31 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.92 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  33.19 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  35.25 
 
 		 490 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.93 
 
 		 363 aa  100  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 730 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  34.63 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  33.99 
 
 		 742 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.14 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 837 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 576 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 451 aa  97.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  30.92 
 
 		 359 aa  97.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  25.08 
 
 		 451 aa  97.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  32.59 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.17 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  25.96 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.48 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  34 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 815 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  29.85 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 493 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  32.05 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  30.77 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 504 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 464 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.09 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  30.34 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  27.27 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  30.28 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  30.28 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.9 
 
 		 491 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  27.27 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  31.33 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 604 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  29.74 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>