More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1334 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 425 aa  833    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  66.28 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  52.57 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  47.56 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  44.96 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  42.79 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  39.68 
 
 		 441 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  39.14 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 487 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  41.55 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  39.76 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29.32 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.08 
 
 		 571 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  38.46 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  34.62 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 467 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.67 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  32 
 
 		 454 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  29.93 
 
 		 328 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  25.58 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25 
 
 		 507 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 364 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.87 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  31.89 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.19 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  25.33 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.25 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.25 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 482 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  31.98 
 
 		 857 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.92 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 477 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  33.33 
 
 		 490 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  30.16 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 484 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  25.39 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  31.22 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  31.92 
 
 		 469 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.42 
 
 		 503 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.96 
 
 		 1162 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 382 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 452 aa  87  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  22.22 
 
 		 471 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.23 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.2 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 425 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  30.84 
 
 		 474 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  24.79 
 
 		 477 aa  86.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  30.31 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  28.62 
 
 		 558 aa  86.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  30.95 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  33.59 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  28.34 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.67 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.23 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  29.23 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  26.27 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.9 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  28.13 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.61 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.97 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>