More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3847 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 428 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  68.38 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  49.76 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.92 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  47.1 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  41.82 
 
 		 435 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  41.04 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  38.59 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  46.98 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  36.88 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  36.75 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  32.21 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  28.34 
 
 		 448 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  31.77 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.43 
 
 		 592 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.89 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  28.89 
 
 		 571 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.61 
 
 		 461 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  31.14 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.45 
 
 		 1162 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 441 aa  96.3  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  29.61 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 476 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  32.28 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 492 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  31.51 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  30.36 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  30.58 
 
 		 363 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 500 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.58 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  35.91 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.49 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.88 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  34.84 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  27.75 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  25.5 
 
 		 491 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  27.88 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 486 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 596 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  31.75 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 524 aa  90.1  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.17 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.43 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  30.64 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 504 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  32 
 
 		 382 aa  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  27.2 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  31.33 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.56 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.72 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  27 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.41 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25.17 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 674 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.98 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  31.4 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  32.89 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 535 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  29.29 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.43 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 476 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  32.82 
 
 		 595 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  29.65 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 534 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  29.34 
 
 		 482 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  29.43 
 
 		 343 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>