More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1845 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 453 aa  878    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  37.69 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  40.33 
 
 		 424 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  32.49 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  33.49 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  31.63 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 435 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  33.49 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  31.48 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  35.85 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  31 
 
 		 435 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.53 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  29.62 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  22.83 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 345 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.83 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.04 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  21.04 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25.25 
 
 		 507 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  29.45 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  29.04 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  25.34 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  26.59 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  26.59 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  22.26 
 
 		 473 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  29.04 
 
 		 276 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.16 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28.27 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 379 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  21.45 
 
 		 310 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  29.96 
 
 		 328 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.15 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  26.88 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  26.2 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  25.54 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.56 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  25 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  22.85 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  28.17 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  23.92 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.65 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  28.33 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  26.32 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.81 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.18 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  30.48 
 
 		 857 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.04 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  27.78 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  27.78 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.27 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  23.53 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>