More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 487 aa  956    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  43.57 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 445 aa  282  8.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  45.13 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  41.88 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  39.23 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  37.41 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  39.29 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.88 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  38.48 
 
 		 432 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  35.71 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  36.12 
 
 		 424 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 428 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 345 aa  176  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  32.97 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.33 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 477 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.43 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  30.94 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  28.26 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.04 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3034  histidine kinase  31.64 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.4 
 
 		 471 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.4 
 
 		 471 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  25.59 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 444 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 379 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 379 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  29.12 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 444 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 752 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 815 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  22.61 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  28.98 
 
 		 364 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  28.98 
 
 		 364 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 458 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  27.52 
 
 		 741 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 382 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.43 
 
 		 468 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 738 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 426 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 709 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  27.04 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  27.06 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  29.89 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  26.16 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  32.16 
 
 		 857 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  29.25 
 
 		 328 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.62 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  30.94 
 
 		 480 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 455 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 383 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.45 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 470 aa  86.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  31.38 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  25 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  32.61 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  27.84 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  22.56 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  28.52 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  28.43 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  26.38 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  28.05 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  27.88 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.36 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  28.52 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.46 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>