More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0586 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
477 aa  938    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0714  histidine kinase  67.02 
 
 
480 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  37.28 
 
 
456 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  33.47 
 
 
474 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  34.3 
 
 
469 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.82 
 
 
464 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
461 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  29.45 
 
 
455 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  32.53 
 
 
461 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
576 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  32.09 
 
 
448 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.67 
 
 
464 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
453 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  28.9 
 
 
469 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
478 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  30.88 
 
 
442 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  31.19 
 
 
454 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
406 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
446 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  27.54 
 
 
468 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
439 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
482 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
444 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
452 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
535 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.77 
 
 
452 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.76 
 
 
477 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  30.34 
 
 
472 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  30.52 
 
 
439 aa  96.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  29.59 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  29.06 
 
 
566 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.17 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.39 
 
 
457 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  28.57 
 
 
542 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  32.09 
 
 
524 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  28.75 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  30.26 
 
 
446 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
462 aa  94.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
500 aa  94  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
425 aa  94  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2754  histidine kinase  29.49 
 
 
491 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
441 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
449 aa  93.6  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  25.74 
 
 
504 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
444 aa  93.2  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  30.46 
 
 
446 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
364 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
469 aa  93.2  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  25.82 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  30.18 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  29.68 
 
 
500 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  29.08 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
605 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
509 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
448 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
482 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.07 
 
 
515 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
469 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  26.56 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  25.98 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  24.29 
 
 
469 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  30.03 
 
 
498 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
449 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
607 aa  90.5  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  30.53 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  30.13 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  26.73 
 
 
558 aa  90.5  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  29.66 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
515 aa  90.5  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
469 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
513 aa  90.1  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  23.08 
 
 
479 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  25.6 
 
 
457 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
453 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
344 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  26.79 
 
 
468 aa  90.1  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.21 
 
 
486 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.02 
 
 
455 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
371 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 
466 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
515 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  31.58 
 
 
535 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
515 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  27.79 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
501 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>