More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5696 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  878    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.4 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.65 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  42.66 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  40.53 
 
 		 474 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  40.42 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  32.97 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0714  histidine kinase  29.49 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  36.31 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 586 aa  123  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25.91 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  36.9 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  32.74 
 
 		 445 aa  113  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  32.3 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.11 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  34.52 
 
 		 608 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  33.94 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  35.49 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.07 
 
 		 1162 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.34 
 
 		 817 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  24.36 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 523 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 330 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.39 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.39 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  31.1 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  31.69 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.73 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  31.02 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  23.75 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  23.75 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  30.24 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.36 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  23.75 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.72 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  23.75 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  31.77 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.28 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  23.75 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.51 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.63 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  30.96 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.5 
 
 		 503 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 607 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 723 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.28 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.15 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 563 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  25.87 
 
 		 431 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.59 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 524 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.68 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  28.21 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.21 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  26.22 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2995  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>