More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3030 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 576 aa  1133    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.51 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.59 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  29.44 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  30.03 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.56 
 
 		 486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  30.69 
 
 		 474 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  28.9 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 504 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.88 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  31.36 
 
 		 445 aa  110  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  29.67 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 504 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.77 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 509 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0714  histidine kinase  28.19 
 
 		 480 aa  107  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 506 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.14 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.22 
 
 		 467 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.59 
 
 		 461 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.28 
 
 		 1162 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  27.91 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  27.91 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 429 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.91 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 463 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.05 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  30.88 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  27.91 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.91 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  28.92 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  26.97 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.32 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  29.86 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.32 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  27.63 
 
 		 468 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  26.65 
 
 		 392 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.61 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 494 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.87 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 505 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.61 
 
 		 467 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 505 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.61 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 495 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 515 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.33 
 
 		 467 aa  100  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  27.33 
 
 		 817 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 496 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  29.34 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  28.86 
 
 		 559 aa  99.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.78 
 
 		 370 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  26.45 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  34.26 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  25.49 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  29.88 
 
 		 494 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  28.33 
 
 		 449 aa  98.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  26.93 
 
 		 425 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 362 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 467 aa  98.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 488 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  27.91 
 
 		 505 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 373 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  29.76 
 
 		 452 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>