More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2598 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  100 
 
 
445 aa  854    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  59.63 
 
 
453 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.82 
 
 
445 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  58.82 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  60.82 
 
 
435 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  43.29 
 
 
425 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
487 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  42.89 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  49.11 
 
 
427 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  39.81 
 
 
435 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.79 
 
 
425 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  38.55 
 
 
433 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  38.46 
 
 
424 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
345 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  33.76 
 
 
453 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  36.26 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.13 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  34.91 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
431 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  33.01 
 
 
508 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.4 
 
 
457 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  30.26 
 
 
571 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  32 
 
 
363 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  27.63 
 
 
411 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  32.66 
 
 
583 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
411 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
411 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
534 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  30.62 
 
 
448 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  28.4 
 
 
418 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 
451 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  23 
 
 
451 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  27.63 
 
 
418 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  31.97 
 
 
450 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
418 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
418 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.92 
 
 
1162 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
418 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
425 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  32.84 
 
 
455 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
467 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
463 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
419 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  31.53 
 
 
450 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
504 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  32.27 
 
 
482 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
730 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
478 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  34.55 
 
 
742 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
470 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  28.73 
 
 
449 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
433 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
556 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  33.7 
 
 
523 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
438 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
575 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
369 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
446 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
752 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  23.86 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  31.94 
 
 
478 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
519 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.65 
 
 
503 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.29 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
517 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  26.98 
 
 
507 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
452 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  29.84 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.54 
 
 
468 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  28.04 
 
 
473 aa  97.8  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
379 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
505 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
523 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
586 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.64 
 
 
467 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
518 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.64 
 
 
467 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
469 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
473 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
515 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
480 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  27.3 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  27.3 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  32.55 
 
 
359 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  32.64 
 
 
454 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  26.98 
 
 
491 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
837 aa  96.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>