More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4222 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  835    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  48.38 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  48.91 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  42.01 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  37.69 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  38.08 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  38.55 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  36.87 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  44.14 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.55 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  38.55 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  34.91 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  36.28 
 
 		 571 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  38 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.19 
 
 		 512 aa  99.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 597 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 487 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  30.51 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.45 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.6 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  31.37 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  28.75 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 477 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.74 
 
 		 491 aa  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  32.54 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  32.31 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.6 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.31 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.36 
 
 		 466 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  31.87 
 
 		 857 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 489 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.19 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  29.03 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  25.61 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  30.77 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.95 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  30 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.43 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  32.61 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.19 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  29.18 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  23.45 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.6 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  32.77 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.51 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  31.12 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.48 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  20.39 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  31.6 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  28.41 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  30.39 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  24.32 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  22.43 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.69 
 
 		 1162 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>