More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  100 
 
 		 426 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  54.5 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  53.76 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  50.6 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  49.64 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  49.04 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  44.71 
 
 		 469 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  43.36 
 
 		 412 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.4 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  51.13 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  38.23 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  47.64 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  35.11 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  30.15 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  29.48 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  29.93 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  29.93 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  29.93 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  29.93 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  29.93 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  30 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  29.63 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  29.63 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  30.93 
 
 		 470 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  30.56 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.47 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  26.13 
 
 		 462 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.62 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  29.04 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  28.57 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  27.55 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  25.75 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  23.01 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  24.61 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  28.95 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  28.95 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  28.95 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  28.88 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  27.3 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  29.1 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  26.37 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  22.29 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  30.63 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.8 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  28.68 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  27.78 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  28.88 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  27.8 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  22.7 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  29.28 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3934  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  23.42 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  27.78 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  29.28 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  33.06 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  29.28 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  31.02 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  26.11 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  23.24 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.99 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  23.55 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  28.67 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  28.9 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  27.47 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  27.93 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>