More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3827 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  803    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.93 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  41.37 
 
 		 412 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  38.23 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.5 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  39.58 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  38.33 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  37.59 
 
 		 441 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  34.43 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  48.31 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  37.5 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  40.08 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29.49 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  31.55 
 
 		 571 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.23 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  32.92 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 581 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  32.2 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  23.15 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  23.03 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  29.81 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  29.11 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  28.05 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  30.79 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  24.29 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  29.56 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  31.9 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  31.62 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  30.34 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  28.47 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  28.33 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  26.16 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  28.24 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  21.78 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  28.71 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  21.66 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 576 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  29.29 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.51 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  26.34 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  27.51 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  29.13 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.18 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  28.47 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.81 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  28.62 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.47 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  27.65 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  29.31 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.23 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  29.94 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  28.48 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>