More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4874 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  100 
 
 		 412 aa  783    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.88 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  43.36 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.16 
 
 		 446 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 431 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  42.86 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  42.69 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  36.26 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  41.37 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  38.21 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  50.84 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  34.41 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  41.57 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.96 
 
 		 448 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 483 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  32.48 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  34.46 
 
 		 456 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 465 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  32.01 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  31.41 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  31 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  28.24 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.8 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 576 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  36.63 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 523 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  36.18 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.52 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  27.87 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  26 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  27.91 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  31.84 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.52 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  30.77 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.52 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.52 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  27.51 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  31.48 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.75 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  29.93 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  29.93 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.8 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.62 
 
 		 1162 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.82 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  29.48 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.56 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  28.57 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  29.03 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.03 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.03 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.03 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  29.69 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.03 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  29.83 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  23.1 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.88 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.67 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  30.23 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  27.5 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.11 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  27.27 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  30.92 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.17 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>