More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0708 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  838    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  67.21 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  54.25 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  47.37 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  44.6 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  43.81 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  41.23 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  42.35 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 427 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  41.15 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 487 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  40.53 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  34.63 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  31.13 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  35.98 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.23 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.37 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.17 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  32.31 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.6 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  37.45 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.2 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  28.68 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  31.03 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 504 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  31.19 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 536 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  22.1 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 396 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  29.89 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  28.88 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  30.95 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 546 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  30.79 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  29.66 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.85 
 
 		 468 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  31.56 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  31.33 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  28.87 
 
 		 817 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.18 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  29.9 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  27.14 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  29.47 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  29.86 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.88 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  26.27 
 
 		 486 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  32.73 
 
 		 490 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.92 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.36 
 
 		 503 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 480 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  31.27 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.37 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 469 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 536 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.88 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  26.96 
 
 		 471 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.31 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  30.42 
 
 		 455 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  29.56 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  26.48 
 
 		 499 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 591 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  29.14 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.22 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.9 
 
 		 477 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  25.99 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  28.2 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>