More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1241 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  100 
 
 		 404 aa  775    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  28.97 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  32.67 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  31.68 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  28.81 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  29.48 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.63 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.07 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  26.98 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 576 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  28.4 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  24.37 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  24.05 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  24.37 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  27.46 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29.67 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  25.47 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  25.29 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  26.07 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.13 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  28.9 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  24.31 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  25.19 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  28.79 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  31.09 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  29.58 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  21.48 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  28.79 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0950  histidine kinase  32.24 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  22.07 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 712 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  27.85 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  27.38 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  26.38 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  22.44 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.04 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  25.96 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  32.35 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  27.86 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  29.39 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  27.74 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 712 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  30.12 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.06 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 712 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  21.28 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.61 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  25.21 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  23.16 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  30.77 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  30.77 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  28.27 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  25.11 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.09 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  23.72 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  28.09 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  28.09 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 602 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  21.72 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  29.87 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.45 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  28.05 
 
 		 456 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  22.89 
 
 		 507 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  24.3 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  29.49 
 
 		 347 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  28.47 
 
 		 450 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 516 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 470 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 578 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>