More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2161 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 602 aa  1238    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2104  histidine kinase  64.66 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1821  putative signal transduction histidine kinase sensor  64.16 
 
 		 703 aa  501  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.982288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  34 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  37.96 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  29.41 
 
 		 415 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  35.75 
 
 		 431 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 427 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  38.3 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 431 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  30.4 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 430 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 432 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 536 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  32.39 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 414 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 536 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 431 aa  88.6  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  26.22 
 
 		 586 aa  89  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  27.73 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 535 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 433 aa  87  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 607 aa  85.9  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  28.63 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  26.17 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  25.52 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  25.82 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  24.31 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.41 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  31.5 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  29.61 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  30.63 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  28.4 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  28.8 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  28.8 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  27.98 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  28.94 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  30.12 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  28.39 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.23 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  27.73 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.08 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  27.12 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  39.06 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  25.77 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  23.58 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  25.68 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  31.95 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  30.04 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  27.57 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  30.53 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  26.43 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  26.75 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  27.57 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  29.1 
 
 		 469 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  27.16 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>