More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 427 aa  825    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  62.3 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  48.38 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  39.41 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  41.26 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  38.11 
 
 		 425 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  37.26 
 
 		 427 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  36.71 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  37.19 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.33 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  38.92 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  34.94 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 476 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  34.82 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.82 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.82 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  28.17 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  33.94 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 482 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.72 
 
 		 363 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.7 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  32.16 
 
 		 857 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  19.63 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  27.79 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 		 470 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  35.57 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  27.45 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  25.11 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  29.68 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  28.12 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  29.85 
 
 		 474 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 431 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.26 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 518 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  19.8 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  25.91 
 
 		 518 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 723 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  26.84 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.58 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 493 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.81 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  31.76 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 466 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  29.53 
 
 		 455 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  33.74 
 
 		 594 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  31.15 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 		 640 aa  93.2  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  25.32 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 462 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  26.92 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.58 
 
 		 1162 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  31.78 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  28.57 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  26.99 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  28.42 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  32.27 
 
 		 497 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  29.32 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 524 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 382 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.19 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 545 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>