More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4423 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  845    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 431 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.6 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  40.28 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 417 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  38.5 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  39.86 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  34.94 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.76 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  43.49 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  43.49 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  40.23 
 
 		 444 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  41.97 
 
 		 360 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  37.53 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  37.15 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.91 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  37.69 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  40.48 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  36.46 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  32.46 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  29.75 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  32.56 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  20.64 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  32.08 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 410 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 469 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.2 
 
 		 640 aa  97.4  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  31.08 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  31.14 
 
 		 566 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  27.95 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 463 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 576 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 574 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  37.11 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  30.08 
 
 		 276 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.08 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 607 aa  92.8  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.57 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  30.33 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  30.15 
 
 		 558 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  30.5 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.84 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.85 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  33.48 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 476 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  33.86 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  33.86 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 472 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 440 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  32.21 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 442 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  31.06 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.1 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.65 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  30.47 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  33.33 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  34.7 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  32.06 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  22.52 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  30.53 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  29.01 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>