More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4020 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  872    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  50.6 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  50.96 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  48.87 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.34 
 
 		 446 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  47.64 
 
 		 445 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  39.2 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.58 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  36.26 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  44.85 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  34.81 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  41.91 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29.22 
 
 		 448 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  27.53 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  29.01 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  29.01 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  29.01 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  29.01 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  29.37 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  27.97 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  27.97 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  29.04 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  27.97 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  27.97 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.67 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  27.97 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  30.4 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  25.78 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  28.26 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0291  helix-turn-helix, AraC type  25.23 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457062  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  25.78 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.28 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.68 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.79 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.7 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  29.23 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  29.32 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  29.32 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.32 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.32 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  29.32 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.81 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.41 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.68 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  28.25 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  26.71 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  27.88 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  27.81 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  27.88 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.1 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  26.8 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  27.88 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.91 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  27.88 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  28.96 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  29.23 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  30.77 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  21.92 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.04 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.09 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  28.69 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  26.94 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  27.44 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.04 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  25.36 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.04 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.04 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>