More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1780 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  87.68 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  50.85 
 
 		 426 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.27 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  49.15 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  46.1 
 
 		 441 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  44.52 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  46.18 
 
 		 441 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.86 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  39.85 
 
 		 425 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  41.97 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  41.24 
 
 		 412 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  22.33 
 
 		 491 aa  94  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 482 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  31.5 
 
 		 461 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 456 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  29.37 
 
 		 456 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  27.33 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  29.86 
 
 		 457 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 462 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  26.32 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  26.32 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.32 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.22 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  26.32 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.32 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  27.95 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  28.09 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  28.09 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  28.09 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  28.09 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  30.07 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  30.07 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.96 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  30.07 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  29.39 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.96 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.13 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.13 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.96 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  27.5 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  29.05 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  29.07 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  26.5 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  27.95 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.52 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  30.51 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  28.72 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  28.72 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  27.48 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  26.28 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.81 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  29.88 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.54 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  29.15 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  27.01 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  27.34 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  29.97 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  26.84 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  26.28 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  32.99 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.65 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  27.8 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  29.78 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  25 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  28.67 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  27.76 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.65 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>