More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3362 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  100 
 
 
445 aa  855    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  59.64 
 
 
446 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  53.76 
 
 
426 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  51.4 
 
 
441 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  51.19 
 
 
441 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  47.64 
 
 
444 aa  345  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  44.67 
 
 
469 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 
417 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.69 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  49.3 
 
 
360 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  39.58 
 
 
425 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  38.21 
 
 
412 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  48.78 
 
 
449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  26.95 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  31.71 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
425 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
496 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
576 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  31.01 
 
 
571 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
461 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  29.89 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
369 aa  86.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  31.83 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  28.98 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  30.6 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  26.6 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  28.12 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  28.12 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.27 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  28.86 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  30.34 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  29.48 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  28.86 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  31.47 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  35.32 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  26.01 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.55 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  26.07 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  29.9 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  30.89 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  28.03 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  32.24 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  31.36 
 
 
516 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
534 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  31.23 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
466 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  33.62 
 
 
467 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.28 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  32.45 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.56 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  31.79 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3066  sensor histidine kinase  24.58 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  27.14 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  26.81 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  27.14 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  27.08 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  29.31 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  24.88 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  27.14 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.59 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  29.11 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  29.67 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
523 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  29.1 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  28.36 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>