More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3066 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3066  sensor histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  941    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3281  sensor histidine kinase  37.29 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00282133  hitchhiker  0.000112665 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05332  histidine kinase  31.03 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000556  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 536 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 535 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 535 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  30.24 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  29.93 
 
 		 431 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  28.82 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 563 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  26.74 
 
 		 538 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0680  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 550 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  26.96 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  25.87 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  29 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  29.29 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  27.22 
 
 		 428 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 376 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  26.75 
 
 		 428 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 448 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  29.71 
 
 		 449 aa  133  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  26.09 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  27.3 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 535 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  27.93 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  28.76 
 
 		 561 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  29.21 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  26.82 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.98 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  30.84 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  28.3 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  27.05 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  27.05 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  27.05 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  27.05 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  26.71 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 760 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  26.71 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  26.71 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  26.71 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  27.05 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  27.54 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  31.56 
 
 		 755 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  30.95 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  30.95 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 459 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  28.12 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.77 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  27.66 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  27.1 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  29.75 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  23.91 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  28.37 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  27.78 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  26.01 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  26.01 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  26.01 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  24.15 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  27.6 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 563 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  28.01 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>