More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05332 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05332  histidine kinase  100 
 
 		 440 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000556  signal transduction histidine kinase  82.05 
 
 		 440 aa  760    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3281  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00282133  hitchhiker  0.000112665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3066  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.65 
 
 		 428 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  30.61 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  32.07 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  30.82 
 
 		 431 aa  126  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.07 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  32.07 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  32.07 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  32.72 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 461 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.97 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  30.17 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  31.97 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  31.97 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  32.31 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  31.74 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  31.74 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  31.67 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  31.67 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  31.77 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  29.18 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  31.19 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  31.1 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.87 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  32.11 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  28.01 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  30.51 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 546 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  28.83 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  31.97 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  31.97 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  29.8 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  31.97 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  31.97 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  30.74 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  28.47 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  32.21 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  30.17 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  31.14 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  31.14 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  31.6 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  33.1 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  29.33 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  28.68 
 
 		 468 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  25.96 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 450 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  31.03 
 
 		 561 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  27.85 
 
 		 452 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  30.69 
 
 		 561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  31.23 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>