More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3295 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  78.17 
 
 		 456 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 465 aa  927    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 449 aa  193  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344841  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  35.63 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  33.94 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.74 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  37.35 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  37.5 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  29.5 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  32 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  32 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.73 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  38.82 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.75 
 
 		 499 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  34.83 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  33.55 
 
 		 379 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  31.32 
 
 		 450 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  32.63 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  30.68 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.14 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  38.56 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.31 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  28.09 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  34.14 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3714  histidine kinase  37.78 
 
 		 338 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 472 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 472 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 472 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.05 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.63 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  35.33 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1726  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.68 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  33.55 
 
 		 491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  30.85 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  29.12 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  30.09 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.96 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  30.38 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.85 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.19 
 
 		 497 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.55 
 
 		 491 aa  133  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.06 
 
 		 817 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 484 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.12 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  27.67 
 
 		 526 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  31.83 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 505 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 505 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.73 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  35.31 
 
 		 460 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>