More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1281 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
449 aa  897    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
456 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
445 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
458 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3714  histidine kinase  40.27 
 
 
338 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.66 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
449 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1726  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.89 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.29 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344841  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  31.06 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.92 
 
 
379 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  26.43 
 
 
526 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
461 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.12 
 
 
478 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.12 
 
 
478 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
447 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  29.84 
 
 
471 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
524 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  32.37 
 
 
471 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
447 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  29.45 
 
 
450 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
450 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
461 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
517 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
469 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
485 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
515 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  31.71 
 
 
450 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
469 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  28.09 
 
 
474 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
441 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
477 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  31.6 
 
 
484 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  30.19 
 
 
472 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35 
 
 
442 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
444 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
462 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
458 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
517 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
461 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.2 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  22.39 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  30.31 
 
 
473 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  29.93 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
449 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
523 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  30.19 
 
 
471 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
519 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
515 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  27.67 
 
 
505 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
518 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  27.86 
 
 
517 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
464 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  32.87 
 
 
465 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  27.67 
 
 
505 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  31.91 
 
 
468 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.33 
 
 
471 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
515 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
456 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
505 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  27.27 
 
 
817 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  27.23 
 
 
505 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.07 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  33.09 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
462 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  29.37 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
464 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  23.26 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  31.08 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
352 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  32.9 
 
 
473 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  33.21 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
447 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
465 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  25.86 
 
 
496 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  24.65 
 
 
469 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3837  sensor protein BasS/PmrB  29.66 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
445 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  34.5 
 
 
467 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
369 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
463 aa  93.2  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
462 aa  93.2  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  30.2 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>