More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1726 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1726  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 
451 aa  909    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  58.98 
 
 
450 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.54 
 
 
461 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.65 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  35.48 
 
 
471 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  29.24 
 
 
450 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
445 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
456 aa  143  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.82 
 
 
471 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.47 
 
 
471 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  29.28 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
447 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  34.74 
 
 
461 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  32.62 
 
 
469 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.67 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
469 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3464  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
482 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.29 
 
 
486 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.67 
 
 
379 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
484 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
480 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  31.17 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  30.36 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  26.43 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
465 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  29.11 
 
 
454 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  32.12 
 
 
463 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  30 
 
 
478 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
459 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  30 
 
 
478 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
450 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  32.53 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
394 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
460 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  30 
 
 
446 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  33.45 
 
 
444 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.12 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  34.05 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  31.03 
 
 
482 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  32.35 
 
 
438 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  31.03 
 
 
482 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.73 
 
 
503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  32.06 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  31.03 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  31.03 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3430  sensor protein QseC  32.2 
 
 
448 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  32.08 
 
 
480 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
462 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  33.07 
 
 
459 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  31.8 
 
 
484 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.93 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
535 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  33.57 
 
 
508 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
480 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
504 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.74 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  30.15 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  30.27 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.09 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>